cómo que = what ? how does that work? are there more examples?
¿Cómo que vas a venir comer? No tengo comida
¿Cómo que te gusta la carne? ¿tú no eres vegetariana?
¿Cómo que vas a venir en tren? creía que tenías coche
How is it that…
I hope it helps danie 
Berta
IDEL
Spanish lessons at Lingq
¿Cómo que … ?
Translates like Berta wrote above, it translates into "How is it that … "
Wayne
I think it translates into “how come…” too.